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EduAnatomist est un logiciel pédagogique de visualisation d'images de neuroimagerie.

C'est un outil de travail interactif, attrayant, et utile pour la compréhension de quelques principes de construction des images cérébrales anatomiques et fonctionnelles et pour leur exploitation pédagogique.

Les techniques de neuroimagerie ont connu ces dernières années un essor considérable. Que ce soit sur le plan anatomique ou sur le plan fonctionnel, ces techniques constituent des avancées majeures qui ont révolutionné, tant dans le domaine médical que dans celui de la recherche fondamentale, notre compréhension du cerveau. Les images cérébrales font aujourd’hui partie de notre univers social. La compréhension du principe de construction de ces images et leur manipulation constituent donc des enjeux réels de formation.

C‘est dans cette perspective que nous avons élaboré en collaboration avec l'INRP et le CEA et le soutien du ministère de l’Éducation nationale et du ministère de l’Enseignement supérieur et de la Recherche, une banque de données de neuroimagerie et un logiciel pédagogique d'utilisation de ces images.

Contenu de la banque d'images cérébrales NeuroPeda

La banque NeuroPeda est une collection d’images IRM anatomiques et fonctionnelles réalisées par des équipes des grands organismes de recherche scientifique (Centre National de la Recherche Scientifique, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, Universités, Commissariat à l'Energie Atomique, Assistances Publiques des Hôpitaux…). Elle regroupe une centaine d'images qui illustrent leurs principales étapes de construction, leur exploitation ainsi que certaines de leurs limites.

Cette banque permet de travailler sur :

• l’identification des principales structures anatomiques cérébrales,
• l’évolution phylogénétique des systèmes nerveux centraux, par comparaisons interspécifiques d’images anatomiques de différentes espèces (Homme, Primates, Mammifères...),
• les pathologies lésionnelles du système nerveux central (tumeurs, accidents vasculaires cérébraux) et leurs conséquences fonctionnelles,
• la spécialisation fonctionnelle de certaines aires du cortex cérébral (somesthésie, motricité, vision, gustation, aires du langage) ainsi que leur organisation anatomo-fonctionnelle (somatotopie, rétinotopie, tonotopie),
• l’activation coordonnée de différentes aires cérébrales pour la réalisation de fonctions cognitives (mémoire et apprentissage),
• la variabilité interindividuelle anatomique et fonctionnelle chez l’homme, par comparaison intraspécifiques d'images individuelles,
• la plasticité anatomo-fonctionnelle du système nerveux central sur le plan développemental et réactionnel (récupération post opératoire du langage notamment).

Prise en main du logiciel Eduanatomist et de la banque d'images NeuroPeda

Un guide d'utilisation de l'application eduAnatomist est disponible ici.

• Utilisation en ligne :

Chaque image de la banque est indexée suivant le profil LOM (Learning Object Metadata) qui précise notamment les champs suivants : l'origine de l'image, le protocole qui a présidé à sa construction, ses caractéristiques techniques, des pistes possibles d'exploitation pédagogique. L'interface d'interrogation de la banque proposée par le logiciel EduAnatomist permet de rechercher facilement des images en ligne par sélection de mots-clés ou en parcourant la classification JAHE des sciences de la vie. Les champs d'indexation précités s'affichent et l'utilisateur peut sélectionner une image pour la visualiser (le téléchargement est automatique).

• Utilisation hors ligne :

L'utilisateur a également la possibilité de télécharger l'intégralité de la banque d'images NeuroPeda sur son poste local pour travailler hors ligne (mais il perd les fonctionnalités liées à l'indexation des données).

La prise en main du logiciel et de la banque peut se faire en deux temps :

• visualisation d'images anatomiques uniquement pour se repérer dans les différents plans de coupe et identifier les principales structures cérébrales,
• visualisation d'images fonctionnelles pour aborder différents aspects du fonctionnement cérébral (exemple de la somesthésie).

• de compléments scientifiques concernant la technique de l'IRM et les bases physiologiques du signal BOLD utilisé en IRM fonctionnelle,

• des expérimentations en classe et des formations d'enseignants réalisées par l'équipe ACCES.

Nouveautés

v1.1.1 :

• Correction dans les chemins d'installation
• Awarness lors des connexions distantes - sablier

v1.1 :

• Utilisation possible d'un proxy HTTP lors de la connexion à la banque d'images
• Mise en cache des requêtes HTTP

Collaboration

EduAnatomist est le fruit d'une collaboration entre le CEA qui a développé le logiciel Anatomist servant de base à eduAnatomist, Pentila qui a développé eduAnatomist et l'INRP qui a élaboré la banque d'images.

Licence

Le logiciel eduAnatomist est diffusé sous licence CeCILL v2.

Support

Pentila fournit un service de support en permettant l'automatisation des mises à jour du logiciel. Pour plus d'information sur ce service de support, n'hésitez pas à nous contacter support@pentila.com

Crédits

Le logiciel eduAnatomist a été réalisé à partir du logiciel Anatomist.

Le logiciel eduAnatomist a été réalisé avec le soutien du ministère de l’Éducation nationale et du ministère de l’Enseignement supérieur et de la Recherche.